天然产物AI研发平台试用简介与使用指引

一、访问链接：https://npaiengine.yaozh.com/

二、访问方式：在学校IP段内用药智网账号绑定的手机号验证码进行登录

三、使用期限：即日起至2025年6月30日 

四、使用内容（标红的功能需联系客服单独开通权限）：

①天然产物活性分析：内含天然产物数据库，及对天然产物结构的AI预测分析功能；

②天然产物反向筛选：基于多靶点、多信号通路、多疾病，反向筛选可能具有活性的天然产物；

③AI网络药理学分析：通过人工智能算法，基于平台百万化合物及靶点、通路、疾病数据库，快速完成网络药理学分析；

④化合物活性预测：预测靶点、信号通路、疾病；

⑤AI分子对接：自主研发AI分子盲对接算法，无需预先对蛋白质结构进行处理，即可预测配体与靶点间的亲和力。 

五、NPAI天然产物AI研发平台简介：

NPAI Engine天然产物AI研发平台是药智网与英国AIA Insights Ltd公司联合推出的天然产物与中药的AI研发产品，于2022年06月正式发布。

平台拥有来源于全球的超3.5W个物种（含中药）的66W+个天然产物数据，应用AIA Insights自主研发的AI-核心算法，将天然产物中的化合物结构数据库，化合物生物活性数据库及其相应的疾病数据库有机的结合起来，形成独特的网络药理学结构。

使用本平台，可以筛选出中药有效成分，预测出一种或多种有效成分针对的特定靶点或疾病。同时针对感兴趣的有效成分，可以进行生物活性预测（包含理化性质预测、靶标预测、ADME预测及下游活性预测，如基因、信号通路、疾病分析、药效团分析、生态毒性及环境毒性预测等），并通过分子对接等方式，进一步验证预测结果。NPAI Engine基于大数据，结合网络药理学和自主研发的人工智能算法，旨在阐明中药作用机理，提供先进、可靠、科学的研发依据，缩短研发周期，节省研发成本。 

六、试用指引：

1．登录

a) 打开平台链接https://npaiengine.yaozh.com/index.html，点击右上登录；

b) 通过药智网账号绑定的手机号验证码进行登录； 

c) 点击进入工作台；

1. 天然产物活性分析

a) 点击“天然产物活性分析”功能；

b) 检索天然产物（点击高级检索可以输入更多筛选项）；

c) 点击全选，点击“聚类分析”，应用人工智能算法，将相似的结构进行聚类后，点击感兴趣的聚类进行总结；（也可以直接勾选自己感兴趣的结构，直接点击“结果分析”，进行AI预测总结）

d) 查看总结结果，点击左侧导航栏，分别查看分析化合物的基本信息、靶点预测、基因本体/信号通路/疾病的富集分析结果。 

2. 天然产物反向筛选

a) 点击“天然产物反向筛选”功能；

b) 选择想要筛选的类型，通过多靶点、多通路、多疾病、多生化反应、多相关药物进行反向筛选。

c) 输入想要检索的内容，并点击搜索。勾选想要筛选的内容，点击执行筛选。

d) 在筛选设置中设定筛选调节，如预测等级、成药性调节、筛选物种范围等。点击确定，得到筛选结果。

e) 查看结果，可通过左侧导航栏进行不同结果切换。

f) 筛选得到结果，可通过点击小分子ID查看详情页，内含分子信息、网络图、物种来源挖掘、食物来源挖掘。

3. AI网络药理学分析

a) 点击“AI网络药理学”功能 

b) 输入一个或多个感兴趣的物种，支持拉丁文和中文。如：Tetradium ruticarpum、Coptis chinensis

c) 如对某一个或多个疾病感兴趣，可选择输入对应的疾病名称。如未输入，则自动获得最佳的疾病富集top数量。

d) 可通过调整靶点预测等级及最大富集数调整最终展示的靶点、通路、疾病的节点数。

e) 点击“立即分析”按钮，即可获得AI网络药理学的网络图。节点类型包括：物种、分子、靶点、kegg、疾病和癌症。可通过界面上的网络信息模块、Opentargets得分等调节网络图节点。（网络信息模块进行筛选、聚焦、高亮等操作，Opentargets调节会根据靶点-疾病因果关系得分减少靶点节点）

f) 点击“天然产物与疾病、靶点关系”，可通过表格的形式，查看结果。

g) 点击“网络分析”，可查看多种结果统计图。如疾病分布气泡图，多靶点协同桑基图、GO/KEGG富集分析气泡图、疾病-有效成分分布图。